应用俄罗斯超级计算机开发COVID-19治疗方法
莫斯科、中国湖南、上海和厦门--(美国商业资讯)--湖南大学、上海交通大学和厦门大学已加入Good Hope Net (https://thegoodhope.net/)国际科学团队(成员来自俄罗斯、芬兰、意大利和加拿大),该团队获得俄罗斯RSC龙卷风(Russian RSC Tornado)超级计算机的高级别优先访问权,用以研究抗击COVID-19冠状病毒感染的方法。
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该跨国研究团队使用最近升级的集群系统,该系统基于第二代英特尔®至强®可扩展处理器,已由俄罗斯领先的高性能计算解决方案提供商RSC Group部署。
Good Hope Net项目旨在开发药物以诊治导致全球大流行的冠状病毒传染性疾病。目前,寻找预防和减轻COVID-19负面影响的治疗方法是当今全球科学界的最高优先事项。当前的研究使用实验物理学、化学和生物学的最新进展来研究病毒的生命周期。复杂的模拟方法需要超级计算能力,用以研究冠状病毒表面的棘蛋白与人类蛋白ACE2之间相互作用的所有细节,已知该蛋白是SARS和SARS-2冠状病毒的入胞点。这将有助于在有限时间内完成所有研究阶段。
俄罗斯科学院克拉斯诺亚尔斯克联邦科学中心数字控制药物与治疗学实验室主管Anna Kichkailo解释道:“COVID-19冠状病毒感染大流行在全球迅速蔓延,表明没有明确的全球性响应计划来抗击新病毒对人类的威胁。明显的短板之一是缺乏用于快速开发诊治药物的技术。我们都拥有不同的能力、知识、技能和资源。我们分散在各地的团队包括病毒学家、生物学家、化学家、数学家和物理科学家。国际合作对于获得快速进展和对全球冠状病毒大流行不断变化的局势做出迅速反应至关重要。我们希望我们的研究能够真正帮助抗击此类感染的传播。”
国际团队成员:
- 俄罗斯科学院西伯利亚分院联邦科学中心Kirensky物理研究所数字控制药物与治疗学实验室和磁场物理实验室(俄罗斯克拉斯诺亚尔斯克),
- V.F. Voyno-Yasenetsky克拉斯诺亚尔斯克州立医科大学生物分子和医学技术实验室(俄罗斯克拉斯诺亚尔斯克)– 项目协调员,
- 罗蒙诺索夫莫斯科州立大学化学系化学控制论实验室(俄罗斯莫斯科),
- 俄罗斯科学院N. M. Emanuel生物化学物理研究所生物分子系统和纳米材料计算机模拟实验室(俄罗斯莫斯科IBCP RAS),
- 俄罗斯科学院西伯利亚分院化学生物学和基础医学科学研究所有机合成实验室(俄罗斯新西伯利亚ICBFM SB RAS),
- 湖南大学分子科学与生物医学实验室(中国),
- 上海交通大学医学院分子医学研究所(中国),
- 厦门大学化学化工学院化学生物学系,福建省厦门市(中国),
- 渥太华大学化学和生物分子科学系生物分析和分子相互作用实验室(加拿大),
- 那不勒斯国家研究委员会(CNR)下属实验内分泌和肿瘤研究所(IEOS)(意大利),
- 那不勒斯费德里科第二大学分子医学和医学生物技术系、药学系(意大利),
- 于韦斯屈莱大学纳米科学中心和化学系(芬兰)。
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JSCC RAS超级计算机(照片:美国商业资讯)
冠状病毒域与人类ACE2的相互作用(图示:美国商业资讯)